Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndufaf2Q59J78 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndufaf2Q59J78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms