Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc47Q505F5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc47Q505F5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc47Q505F5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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