Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srek1ip1Q4V9W2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srek1ip1Q4V9W2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms