Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim26Q3V460 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim26Q3V460 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim26Q3V460 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim26Q3V460 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim26Q3V460 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms