Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldlrad2Q3V0V0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms