Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc9Q3V038 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc9Q3V038 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms