Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SvipQ3UZP4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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