Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spg7Q3ULF4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spg7Q3ULF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spg7Q3ULF4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms