Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam83fQ3UKU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam83fQ3UKU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam83fQ3UKU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms