Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft2Q3UF64 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft2Q3UF64 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft2Q3UF64 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnft2Q3UF64 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft2Q3UF64 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms