Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trafd1Q3UDK1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trafd1Q3UDK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trafd1Q3UDK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms