Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
InipQ3TXT3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
InipQ3TXT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
InipQ3TXT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms