Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q3TTJ4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3TTJ4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms