Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem104Q3TB48 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem104Q3TB48 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms