Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vax1Q2NKI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax1Q2NKI2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms