Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp1aQ2LKU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp1aQ2LKU9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms