Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd12Q0VE29 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd12Q0VE29 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms