Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnn2Q08093 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 416.2 ms