Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms