Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fmn1Q05860 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fmn1Q05860 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fmn1Q05860 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms