Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1Q04750 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1Q04750 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms