Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnb1Q03717 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms