Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nucb1Q02819 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nucb1Q02819 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nucb1Q02819 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nucb1Q02819 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms