Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Muc1Q02496 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Muc1Q02496 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Muc1Q02496 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms