Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col1a2Q01149 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms