Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms