Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp9bP98195 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9bP98195 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9bP98195 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms