Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AlkP97793 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
AlkP97793 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AlkP97793 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AlkP97793 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AlkP97793 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AlkP97793 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AlkP97793 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
AlkP97793 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AlkP97793 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AlkP97793 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AlkP97793 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AlkP97793 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AlkP97793 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AlkP97793 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
AlkP97793 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
AlkP97793 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
AlkP97793 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AlkP97793 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AlkP97793 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AlkP97793 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AlkP97793 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AlkP97793 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AlkP97793 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AlkP97793 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AlkP97793 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AlkP97793 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms