Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cited1P97769 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited1P97769 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited1P97769 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms