Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkp1P97350 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkp1P97350 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms