Protein–RNA interactions for Protein: P80317

Cct6a, T-complex protein 1 subunit zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct6aP80317 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cct6aP80317 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cct6aP80317 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cct6aP80317 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms