Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxna3P70208 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxna3P70208 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxna3P70208 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms