Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SbdsP70122 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SbdsP70122 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SbdsP70122 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SbdsP70122 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms