Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crabp1P62965 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crabp1P62965 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crabp1P62965 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crabp1P62965 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Crabp1P62965 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms