Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms