Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp46P62069 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp46P62069 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Usp46P62069 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp46P62069 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp46P62069 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp46P62069 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp46P62069 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp46P62069 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp46P62069 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp46P62069 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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