Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmo4P61969 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo4P61969 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms