Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia3P60469 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia3P60469 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms