Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab4aP56371 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab4aP56371 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms