Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ephb4P54761 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb4P54761 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb4P54761 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms