Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad23bP54728 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad23bP54728 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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