Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cux1P53564 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cux1P53564 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Cux1P53564 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cux1P53564 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cux1P53564 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cux1P53564 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cux1P53564 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cux1P53564 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms