Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41l4aP52963 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4aP52963 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4aP52963 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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