Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FanccP50652 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FanccP50652 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FanccP50652 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FanccP50652 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FanccP50652 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FanccP50652 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FanccP50652 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FanccP50652 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FanccP50652 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FanccP50652 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FanccP50652 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FanccP50652 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FanccP50652 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FanccP50652 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FanccP50652 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FanccP50652 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FanccP50652 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FanccP50652 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FanccP50652 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FanccP50652 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FanccP50652 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FanccP50652 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FanccP50652 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FanccP50652 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FanccP50652 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FanccP50652 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FanccP50652 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FanccP50652 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FanccP50652 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FanccP50652 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms