Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn1cP49919 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdkn1cP49919 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms