Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5P49615 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5P49615 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms