Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg3P47867 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg3P47867 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms