Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Timp3P39876 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Timp3P39876 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Timp3P39876 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms