Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig1P37913 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lig1P37913 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms