Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc1P34928 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc1P34928 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms